S pádom Byzancie, druhé bulharskej Ríša bola založená a Srbsko sa stalo nezávislým kráľovstvom. Byzantská ríša bola obnovená v 1261 ale postrádal svojej bývalej pevnosti. Srbsko vstúpilo na obdobie expanzie a do polovice roku 1300 sa vytvorila veľkú ríšu. Bosna, rozšírenie v rovnakom období, v prílohe susednej Herzegovina. Maďarsko expandovali južnej.
V roku 1354 osmanskí Turci, ktorí už dobyli väčšinu z Malej Ázie, prešiel do Balkánu. Byzantská Ríše klesla k nim v roku 1453, a na začiatku 16. storočia prakticky celý polostrov bol podmanil.
Novovek
Po jeho veľkej ére dobývania a expanzie, Osmanská ríša postupne klesal v elánom. Rakúsko a Rusko boli obaja usilujúce o územnej zisk, a Benátčania chceli obnoviť svoje obchodné cesty. Pohovky boli často vo vojne s jedným alebo viacerými z týchto právomocí a 1700 začal strácať územia na Balkáne. Vojny pokračujúce v priebehu 18. a 19. storočia viedlo k ďalším stratám. Grécko bolo prvé získať nezávislosť, v roku 1832, a na konci storočia väčšina ostatných balkánskych krajín vyhral svoju nezávislosť tiež.
dve balkánske vojny, 1912-13, eliminovaný tureckej nadvlády v Európe s výnimkou oblasti okolo Konštantínopolu. Austro-maďarská Ríše držal územia na severozápade, ale Rusko nepodarilo preniknúť na Balkán. Odpor proti Rakúsku bola príčinou incidentu, ktorý sa vyzráža prvej svetovej vojny, ktorý priniesol do konca rakúsko-uhorskej monarchie. Nový národ, Kráľovstvo Srbov, Chorvátov a Slovincov, bol vytvorený; to bolo neskôr premenované na Juhosláviu.
Balkánske Entente, vedená Francúzskom, bol organizovaný v roku 1934 v snahe zabrániť nemeckej prenikanie do Balkánu. Rumunsko, Juhoslávia, Grécko, a Turecko boli členmi. Agresívne nemeckej obchodnej politiky a diplomatické snahy v priebehu roka 1930, však, rozbila Entente, a počas druhej svetovej vojny II Bulharsko a Rumunsko pripojilo k Axis sily. (Albánsko bol pripojený Taliansku v roku 1939.) V roku 1941 Nemci napadl