Južnej Karolíny kapitál bol oficiálne presťahoval do Kolumbie v roku 1786, ale Charleston zostal dôležitým politickým centrom. Jeho obyvatelia hral vedúcu úlohu v udalostiach, ktoré viedli k občianskej vojne. Prvý stretnutiu vojnové Konfederácie útoku na federálnej posádky v Fort Sumter, došlo tu v apríli 1861. Prístav bol čoskoro zablokovali námorných síl Únie ale mesto nepadol do únie do roku 1865.
Občianska vojna nasledovalo dlhé obdobie ekonomického poklesu. Silné zemetrasenie v roku 1886 pridal k situácii mesta. Charleston sa čiastočne zotavili o čase prvej svetovej vojny, ale nebol vystavený významný ekonomický rast až do obdobia počas a po druhej svetovej vojne. Hlavný hurikán udrel na mesto v roku 1989.
Počet obyvateľov :. 96,650