V deviatom storočí západnej Turkestan stal doménou moslimského perzského Samanids, kto robil Bukhara (ich kapitálu) súper Bagdade v kráse a kultúry. Kontrola oblasti klesal na Turkami v roku 999, a národy domorodcov boli postupne ktorý absorbovali.
Mongoli Džingischána podmanil celej strednej Ázie počas 1219-20, a Turkestan stal častí mongolskej ríše , Poradie udržiavaný Mongolov umožnil to pre Marco Polo cestovať cez staré hodvábne chodníky do Číny v rokoch 1270 a výsledný obchod prekvital po niekoľko storočí.
Vzhľadom k tomu, mongolská Ríše začal sa rozdeliť v 14. storočia, Tamerlane chopil sa moci na západe. Pod jeho dedičov, však, jeho ríša sa scvrkla do regiónu Buchara-Samarkand, a na začiatku 16. storočia zmizol. Turkestan bol rozkol medzi niekoľkými bojujúcich tureckej kniežatstva. Silk Road sa stal príliš nebezpečné používať; Anthony Jenkinson, anglický obchodník, v roku 1558 by mohlo ísť ďalej na východ než Bukhara. Bol nájdený námorných trás na Ďaleký východ, však, a v strednej Ázii už nebolo dôležité pre západný svet.
V polovici 18. storočia Ruska rozšíril do severozápadnej Turkestanu a Čína začala podrobovať juhovýchodnej región. Konečné územnú zálohy Ruskej došlo v druhej polovici 19. storočia. V roku 1922 západnej a centrálnej časti Turkestanu sa stala súčasťou Sovietskeho zväzu. Sovietskej Turkestan bola tvorená Uzbek, Turkmen, Tajik, Kyrgyz, a časť kazašských sovietskych socialistických republík. V roku 1991, po rozpade Sovietskeho zväzu, sa tieto republikami stal sa nezávislý. 
[1] [2]