V marci 1939 Hitlerova vojská napádala a zaberala zvyšok Československa. Čechy a Morava boli pripojené k Nemecku; Slovensko bola založená ako samostatný štát pod nemeckou ochranou. Vojna-time vláda-v-vyhnanstva bola založená Beneš v Londýne v roku 1940. Počas druhej svetovej vojny, Čechoslováci viedli partizánsku vojnu proti nacistickej okupácii síl. Jeden akt odvety nacistami bolo úplné zničenie Lidíc. Krajina bola oslobodená sovietskymi a americkými vojskami. 1944-45.
Komunisti chopiť sa moci
Po vojne, predvojnovej hranice Československa boli obnovené, s výnimkou východnom cípe krajiny (Podkarpatskej Rusi), ktorý bol včlenený do Sovietskeho zväzu. Najviac sudetskí Nemci boli vyhnaní. Koaličnú vládu, ktorá zahŕňala komunisti, bol organizovaný s Benešom ako prezident. S zemi pod neustálym tlakom zo Sovietskeho zväzu, KSČ bol schopný zvýšiť svoju silu. V februári 1948, komunisti boli dosť silný, aby chytiť kontrolu nad vládou. Čoskoro potom, minister zahraničia Jan Masaryk, syn prvého prezidenta a vedúci anti-komunista, bol nájdený mŕtvy za záhadných okolností. V máji 1948 viac obmedzujúce ústava nahradil demokratickú ústavu 1920. Budúci mesiac, Beneš odstúpil, zlomený ako v oblasti zdravia a ducha.
Nová vláda bola silne ovplyvnená Sovietskym zväzom a udržiavaný v blízkosti obchodné a kultúrne vzťahy s ostatnými sovietskych satelitov krajín. Všetky priemysly boli znárodnené. Všetko opozície voči komunizmu bol vyradený. Podľa Antonína Novotného, ktorý sa stal súčasťou komunistickej} šéf v roku 1953 a prezident Československa v roku 1957, vláda bola jednou z najviac represívne vo východnej Európe. V roku 1960 bola prijatá nová ústava, vyhlasovať Československo socialistická republika V skutočnosti, to robilo vládne výhradou vôli komunistickej strany.
Na nejakú dobu, že tlaky sa hromadí medzi ľuďmi pre liberalizáciu komunistický režim. Kedy sľubované reformy neprišiel, skupina mladších a viac progresívnych komunistov na čele s slovenský komunistický vodca Alexandra Dubčeka, vyhnal Novotný od moci čoskoro v roku 1968. ďalekosiahle politické, ekonomické a sociálne reformy boli vyhlásené.
Sovietsky zväz, sa obávať, že požiadavky na reformy by sa šíril do ďalších krajín komunistického bloku, a tým oslabiť jeho pozíciu, pokúšal sa zastrašiť Čechoslovákmi a priniesť zastavenie progr
