V skoro 1900 je viac ako polovica z Mississippi populácie bola čierna, ale černosi boli poprel hlasovať prísne uplatňovali požiadavky gramotnosť-testu v 1890 ústave. Jeden z najúspešnejších politických vodcov štátu bolo Theodore Bilbo (1877-1947), ktorý sa uchádzal o úrad na platforme Belošské nadradenosti. On slúžil ako guvernér dvakrát pred odoslaním do Senátu USA v roku 1934, kde zostal až do svojej smrti.
1960 černochov už tvorili väčšinu dospelých veku pre právo voliť, ale pohyb sa zaregistrovať pre černochov Hlasovanie sa stretol s jednotným odporom. V roku 1962 federálny súd nariadil University of Mississippi zapísať James Meredith ako prvý čierny študent. Vzdor poriadku bola vedená guvernérom Ross Barnett, a vážna vzbura vypukla na univerzite. Federálnej vojaci boli potreboval pomoc Meredith vstúpiť na univerzitu. Ďalšie rasovo motivované násilie zahŕňali vraždu roku 1963 civilné vodcu práva Medgar Evers, a v roku 1964 z troch pracovníkov občianskych práv.
V polovici 1960, účasť černochov v politike zvýšil. V roku 1969 Charles Evers, Medgar brat, bol zvolený za starostu Fayette-prvý čierny starosta s miešanci mesta Mississippi od Reconstruction. Tiež v neskorej 1960, biela opozícia voči integrácii verejnej škole viedol rasových nepokojov. Tým, skoro 1970, súd nariadil desegregáciu štátnych škôl na všetkých úrovniach bola v plnom prúde.
V roku 1969 sa kapela Mississippi Choctaw Indov otvoril stavebnú firmu na výstavbu domovov pre členov kmeňa. Tým sa výrazne zvýšilo bohatstvo skupiny a urobil túto kapelu jedným z najlepších zamestnávateľov v štáte.
V neskorý 1980, legislatíva sa odohrala na reformu vlády kraja a zvýšiť finančné prostriedky na vzdelanie. Voliči zvolený prvým republikánskeho guvernéra od Reconstruction, Kirk Fordice, v roku 1991.
V ranom 2000s, konštrukcia štátnej vlajke, ktorá bola prijatá v roku 1894, sa stala témou diskusie, pretože roh zobrazí občianskej vojny emblém Confederate štátov; Afroameričania a iní namietali, pretože symboliky spojené s otroctvom. Guvernér menovaný komisia navrhla novú podobu, ale v roku 2001 voliči odmietli nový dizajn v prospech verzia 1894.
hurikán Katrina udrel na pobreží Mexického zálivu v roku 2005 a spôsobila vážne škody. Zvlášť ťažké hit bola oblasť okolo Biloxi a Gulfport.
