Občianskej vojny a po
Na vypuknutia občianskych vojna, Frmont bol poverený generálmajor dobrovoľníkov a daný rozkaz odboru Západu, so sídlom v St. Louis, Missouri. On bol odstránený prezidenta Lincolna potom nariadil, bez povolenia, uvoľňovať otrokov v Missouri, štátne hranice, ktorý nebol vystúpil ale tam, kde boli vysoké napätie. V roku 1862 mu bolo zverené velenie menší význam v západnej Virgínii, ale ukázala ako neúčinná v oponovať Shenandoah kampaň Konfederácie. On vzdal sa jeho hodnosti skoro po.
Radikálna republikáni nominovaný Frmont na prezidenta v roku 1864, ale on ustúpil. Po občianskej vojne, Frmont stratil jeho bohatstvo cez neúspešnom železničnom podniku. Prezident Hayes ho zachránil z chudoby by menovať ho guvernérom Arizona územia, ktorú zastával v priebehu 187883. pani Frmont tiež pomáhal s financiami od písania článkov pre rôzne publikácií. Tesne pred Frmont zomrel, prezident Harrison ho obnoviť do armády ako vo výslužbe generálmajora s plat.