Baer je štúdia embryá, aby viedol k jeho odhaleniu a popis funkcie iných stavovcov štruktúry, vrátane chorion, čo prispieva k tvorenie placenty a notochord, je podlhovastých šnúra buniek, ktorá podporuje štruktúru stavovcov embryí. Poukazuje na to, nervové záhyby v notochord, Baer Navrhovaný thatthey sú počiatky nervového systému.
V roku 1834, Baer presťahoval do Petrohradu, Rusko. On sa stal riadnym členom Akadémie vied a zastával viacero administratívnych pozíciách. Hoci on robil žiadnu ďalšiu-embryologický výskumu, on pokračoval prispieť k vede ako prírodovedec. Urobil expedícií na riedko obývané severe Ruska, z ktorej zhromažďujú vzorky. Island Tam bol menovaný v jeho cti. Baer používal jeho meranie lebky exemplárov: ako základ pre práce v ktorom on sa navrhovanej všetky ľudské lebky mohol mať pôvod v jednom type. Táto práca, ktoré publikoval v roku 1859, rovnaký rok ako Charlesa Roberta Darwina Pôvod druhov. V roku 1861, Baer usporiadal stretnutie craniologists (vedcov špecializujúca sa špecializovať v ľudských lebiek) v Nemecku. Toto stretnutie viedlo k založeniu nemeckej antropologickej spoločnosti. Baer, čo tak pomocný v založenia ruskej geografickej spoločnosti a ruskej spoločnosti entomologické. Okrem toho sú sily za Baer vysvetlené charakteristické konfiguráciu ruských riečnych brehov. Jeho vývoj rýb (1835) Povzbudený nové záujmy, a to ako vedecké a ekonomické, v ruských rybolovu.