Crowfoot vytvoril techniku určiť štruktúru cholesterolu jodidu, sterol, ktorý bol prvý komplexný organický materiál, ktorý má byť určený úplne pomocou röntgenovej kryštalografie. Použitie tisíce matematické výpočty, Hodgkin vypracoval schému molekuly cholesterolu ukazuje hustotu elektrónov postihnutých röntgenového lúča. Táto mapa hustoty uvedené, kde sa nachádza atómy. Ona potom vytvoril umelé kryštály, ktoré boli identické s prírodnými okrem toho, že by obsahovali ďalší atóm ťažkého prvku. Ona porovnanie X-ray fotografie umelých a prírodných kryštálov na doplnenie chýbajúcich častí štruktúry kryštálu.
Získala doktorát z Cambridge v roku 1937 a pokračoval učiť u Oxforde pre zvyšok jej kariéry.
V roku 1937 sa vydala za Thomasa L. Crowfoot Hodgkin, historik. Ich pracovné miesta držal je od seba počas týždňa, ale strávili víkendy spoločne. Pár mal tri deti.
Počas druhej svetovej vojny (1939-1945), Dorothy Crowfoot Hodgkin sa pripojil k skupine vedcov, snažiacich sa určiť štruktúru penicilínu, silný liek používaný na liečbu infekcií spôsobených baktériami. V roku 1945, Hodgkinov a jej kolegovia uspel.
Po druhej svetovej vojne, Hodgkinov pomohol založiť Medzinárodný zväz Crystallography. Ona tiež sa pripojil niekoľko organizácií pracujúcich pre svetový mier. Pretože niektoré z týchto organizácií prijatých komunistami v čase, keď americká vláda proti komunizmu, Hodgkinov bol niekedy obmedzený na svojich cestách do Spojených štátov.
V roku 1947, Hodgkinov bol volil (člen) kráľovskej spoločnosti , predné vedecká organizácia, v Spojenom kráľovstve.
V roku 1948 začal pracovať Hodgkinov určiť štruktúru vitamínu B12. Znalosť molekulárnej štruktúry vitamínu by vedcom pomôcť lepšie pochopiť, ako telo používa túto látku na vybudovanie červené krvinky a prevenciu ochorení zvanej zhubnej anémie, ktorá nastane, keď vitamín B12 nemôžu byť absorbované v tele. Táto informácia by bolo užitočné, aby farmaceutické spoločnosti, ktoré chceli produkujú chemickú formu vitamínu B12 pre ľudí, ktorí nemohli nabažiť prírodného vitamínu z ich potravy.
Hodgkinov pustil sa do práce s tímom výskumníkov. Pracovala tiež s Kennethom TrueBlood, ktorý viedol skupinu americkýc
