S kolegom, Cooper vyvinul softvérový systém, ktorý by mohol rozpoznať a premeniť ručne písané listy do napísaných znakov. International Business Machines Corporation (IBM) predstavila systém v roku 1987.
V roku 1991, Cooper sa stal prvým riaditeľom Inštitútu Brown University pre mozog a Neural Systems. Inštitút združuje matematiky, psychológovia, inžinieri, fyzici, lingvisti, počítačové vedca, biológov a k štúdiu fungovania mozgu a nervovej sústavy vyšších zvierat, vrátane ľudských bytostí.
Cooper bol ocenený siedmimi čestný stupňov. Je členom Americkej akadémie umení a vied, American Physical Society, Národnej akadémie vied, americkej filozofickej spoločnosti, a sponzorom Federácie amerických vedcov. V roku 1968, spolu s Schrieffera, mu bola udelená Comstock Cenu Národnej akadémie vied.
