Prirodzený výber je kľúčom k pochopeniu toho, ako sa vyvíja symbióza. V danej populácii, niektoré organizmy budú mať vlastnosti, ktoré sú výhodnejšie pre úspešné reprodukciu než ostatní. Organizmy s týmito rysy sú teda väčšia pravdepodobnosť, že im odovzdať k nasledujúcim generáciám, zatiaľ čo tí bez nich majú väčšiu šancu na umieranie, než sa množiť. Tak, v priebehu mnohých generácií, populácia bude mať tendenciu pozerať sa viac a viac ako jednotlivci s úspešnými rysy
Úspech či neúspech vlastností závisí na populačnej tlak. - Okolnosti, ktoré sťažujú pre fyzické osoby, prežiť. Vlastnosti, ktoré umožňujú tvor využívať iné formy života v jeho prostredí, bude rovnako úspešný ako vlastnosti, ktoré mu umožňujú uniknúť (alebo jesť) je.
Väčšina symbiotické vzťahy Pravdepodobne začal ako fakultatívne. Cez mnoho generácií, organizmy prišlo viac závisieť na symbióze, pretože prirodzený výber favorizoval tie vlastnosti a iné nie. Nakoniec, symbióza stal jediným zdrojom potravy, prístrešia, enzýmu alebo čokoľvek iné, čo sa symbiotes odvodené od seba.
Ďalší spôsob, ako sa pozerať na symbióze je Evolution nástrojov. Stromy potrebujú živiny nájdené hlboko v pôde. Oni mohli vyvinúť účinnejšie koreňové systémy, ktoré by im umožnili extrahovať týchto živín seba - v skutočnosti, mnoho stromov má. Ale to môže trvať veľa času (desiatky tisíc rokov a viac), a mohla by sa nestalo vôbec. To len tak sa stane, že huby už majú túto schopnosť. Keď sa tieto dva druhy sa ocitnú v tesnej blízkosti, je oveľa rýchlejší vyvíjať spôsob, ako začleniť " nástroj " už k dispozícii na ďalší organizmus, ako znovu vynájsť koleso.
Niektorí biológovia sú zástancovia teórie známe ako symbiogeneze. Táto teória, ktorá má pomerne široké prijatie, naznačuje, že symbióza je vlastne kľúčom k počiatkom zložitý život na Zemi. Symbiogeneze teoretici si myslia, že stále viac diverzifikované mikróby vstúpil do série symbiotických vzťahov s rôznymi mikróbmi plnenie úloh životne dôležitých pre mikrobiálne existenciu. Tieto vzťahy sa vyvinuli do pevne integrovanej siete vzájomných mikróbov, z ktorých každá pôsobí ako koliesko v stroji. Oni nakoniec vyvinula puzdro je všetky prikladať. Mikróby, ktoré tvorili tento " team " sa stali časťou bunky :. mitochondrií, jadrá, ribozómy