V Európe, ľudia mali ťažšie prijíma existencie slnečných škvŕn. To bolo preto, že všetci - vrátane katolíckej cirkvi - prijal grécky filozof Aristotelovu myšlienku, že nebesia sú dokonalé a nemenné. Namiesto toho, keď veľké slnečné škvrna sa objavila na osem dní v AD 807, sa odmietol jav ako priechodu planéty Merkúr cez slnku.
Avšak, po ďalekohľad bol vyvinutý v skorých 1600, taliansky astronóm Galileo a iní jasne videl, že slnko sa tmavé škvrny. Astronóm a katolícky kňaz Christoph Scheiner sa snažil prísť s vysvetlením, ktoré neboli v rozpore cirkevné učenie; on argumentoval, že škvrny skutočne boli neobjavené planéty, ktorá obiehala v tesnej blízkosti Slnka a boli viditeľné iba vtedy, keď boli planéty pred slnkom. Cez pokusy Scheiner je, Galileo správne zistili, že slnečné škvrny boli súčasťou samotného Slnka prostredníctvom starostlivo študovať pohyb slnečných škvŕn v priebehu času. V polovici roka 1700, európski astronómovia nahrávali a zostavovanie ich pozorovanie slnečných škvŕn na dennej báze.
Ako vedci hromadí viac a viac dát, začali pozorovať, že slnečnej aktivity vyvinul vzor. V roku 1843, astronóm S.H. Schwabe bol prvý popisovať cyklus slnečných škvŕn 11 rokov
Od tej doby, vedci používajú používali rad nástrojov -. Vrátane obrích slnečných ďalekohľadov, ktoré boli špeciálne chladených pozorovať slnečné svetlo, bez toho aby bola narušená jeho tepla - sa dozvedieť viac o fyzike slnečných škvŕn. Astronóm George Ellery Hale objavil slnečné škvrny "magnetické prírodu a používa tento objav na preukázanie existencie veľkého magnetického poľa v slnečnej interiéru. Viac nedávno, astronómovia objavili starspots - slnečné škvrny na iných hviezd. Jeden obrie hviezda, HD 12545, nesie si miesto 10.000 krát väčšia ako najväčšia škvrny pozorovaných na slnku.
