Veľká Británia poslal armádu pod vojvodu z Wellingtonu na pomoc Španielsko, rovnako ako Portugalci, a po dobu štyroch rokov francúzske sily boli držané na obsadené Pyrenejskom polostrove, aj keď Napoleon potreboval niekde inde.
Vojna proti Rakúsko
Rakúsko v apríli 1809, deklaroval vojnu s Francúzskom. Do mesiaca Napoleon bol vo Viedni. Jeho armáda bola kontrolovaná, ale pri Aspern a na Essling. U Wagrame, 5. júla, Rakúšania boli porazení. On potom uložila Rakúsko zmluve Schönbrunn, pričom z Rakúska Illyrian provincií (v čom je teraz Poľsko, Slovinsko a Chorvátsko).
Druhého manželstvo
Napoleonova odhodlanie založiť dedičné dynastiu prinútila ho, aby sa rozpustil jeho manželstvo s Josephine, ktorí ho nemohli zniesť dediča. Teraz 40 rokov, požiadal o ruku 18-ročného arcivojvodkyňa Marie Louise, dcérou rakúskeho cisára. Oženil sa s ňou v zastúpení dňa 11. marca a formálne v kostole Svadba na 2. apríla, 1810. Požadovaná syn sa narodil 11. marca 1811, a dostal titul kráľa Ríma.
Inváziu Ruska
Teraz 42, Napoleon sa zdal byť najvyššie v Európe, ale Alexander-povzbudený Napoleonova starého politického súper Talleyrand-obrátila proti nemu. Car sa vzdal k Continental systému v roku 1810, a Rusko pripravení vstúpiť do koalície proti Napoleonovi
Napoleon zostavil obrovskú silu pre jeho čas, 600.000 ľudí, z ktorých menej ako 200.000 boli Francúzi .; zvyšok boli Nemci, rakúska, poľská a taliansky. 24. júna 1812, Napoleon začal inváziu do Ruska. Rusi ustúpili, vypaľovanie dedín a ničí úrodu a hospodárske zvieratá, takže nič cenného na Napoleonovej sily. Napoleon naháňal je s úžasnou rýchlosťou. Podľa generála Michaila Kutuzova, ruská armáda urobila stánku na Borodine a bol porazený v krvavej bitke 7. septembra
Napoleon vstúpil do Moskvy o týždeň neskôr. Ďalší deň, mesto bolo v plameňoch. Moskva, s výnimkou Kremľa, bol takmer úplne zničený, ale Napoleon zostal v meste na päť týždňov v nádeji, že vyjednať mier s Alexandrom. Nič pochádzalo z týchto snáh, a nedostatok dodávok dal Napoleonovi inú možnosť, ako viesť svoje víťazné armády domovu. Pochod čoskoro sa zmenil na katastrofu. Hladovanie, chladné počasie, a choroby, rovnako ak