Watson a Crick dostal nejakú pomoc s ich vyšetrovaní, z Rosalind Elsie Franklinová, britský fyzikálne chemik a spolupracovníka Wilkins na kráľovskej vysokej škole v Londýne. Watson a Crick sa snažia cez tvaru korupciou, kedy bol Watson znázornené röntgenové difrakcie vyrobený Franklin, ktorý jasne ukázal, že štruktúry DNA bolo, že skrutkovice. Aj keď táto fotografia sa ukázalo rozhodujúce pre Watson a Crick je objav, Franklin bol nevedomý, že ju videl. Zomrela na rakovinu v roku 1958 a Watson ponúkol oneskorený uznanie príspevku Franklina v jeho knihe Double Helix. Watson a Crick hlásené svoje výsledky v dvoch článkov publikovaných na jar roku 1953. Prvý článok bol sprevádzaný ilustráciu skrutkovice, ťahané Cricka manželkou, Odile.
Neskôr v roku 1953, Watson prijal miesto vedúci vedecký pracovník v biológii na California Institute of Technology, Pasadena, Kalifornia. O dva roky neskôr bol menovaný docentom biológie na Harvardskej univerzite, kde bol menovaný docentom v roku 1958 a profesorom v roku 1961. O sedem rokov neskôr, Watson stal riaditeľom Cold Spring Harbor Laboratory v Cold Spring Harbor, Long Island, New York, zatiaľ čo ešte zostane na fakulte na Harvarde. Pokračoval s touto dvojaký povinnosti až do roku 1976, kedy odišiel na Harvard venovať všetky svoje sily do Cold Spring Harbor.
Vzhľadom k tomu, za predpokladu, že vedenie na Cold Spring Harbor, Watson podporoval výskum v oblasti nádorovej virológie a tento riadok o vyšetrovaní viedla vedcov k lepšiemu porozumeniu génov rakoviny. Watson tiež zdôraznil, vzdelanie a rozšíril ponuku triedy laboratória pre pokročilých študentov v molekulárnej biológii aj stredné a vysoké školy. Podporovať jeho vzdelávacie ciele, založil stupeň-udeľovať inštitúcii, Cold Spring Harbor Laboratory Watson škola biologických vied. V roku 1994 sa stal prezidentom Cold Spring Harbor Laboratory, túto pozíciu si stále drží. Ako prezident, on pomáhal sprievodcovia všeobecnú politiku pre zariadenia.
V roku 1988, Watson sa stal asistentom réžie, ao rok neskôr riaditeľom, z Národného centra pre projekt ľudského genómu z National Institutes of Health (NIH ). Zatiaľ čo dohliad
