syntézou vytvorený amoniak môže byť tiež ľahko previesť na výbušniny, a ako svetová vojna (1914-1918) začal, Haber ponúkol svoje odborné znalosti na nemeckou vládou. Pod jeho vedením sa ústav produkoval toľko výbušné munície, ktorá je uložená nemeckej armády z kapituláciu v čase, keď sa ich munície takmer vyčerpaná. Haber tiež dohliadal experimenty do chemických zbraní, a jeho úspech v rozvoji plynný chlór priniesol o približne 15.000 spojeneckých vojakov obetí, z ktorých 5000 boli úmrtia, keď to bol prepustený experimentálne na bojovom poli apríla, 22., 1915.
hoci Haber bol 1.918 laureát Nobelovej ceny za chémiu, to nebolo až do roku 1919, po vojne, že on prijal jeho cenu. Bol špecificky spomenie pre dobrú jeho objav priviedol na svet, a on bol hlboko ustarostený, keď tam bol však medzinárodné protesty proti jeho víťazstvo, pretože jeho akcie vo vojne.
Medzi vojnami Haber pracoval na vývoji postup extrakcie zlato z morskej vody, ktorý on dúfal by pomôcť platiť masívne povojnovej reparácie Allies požadoval Nemecka. Aj keď snaha zlyhala, pod vedením Haber, Kaiser Wilhelm Institute sa stal jedným z najväčších svetových vedeckých výskumných zariadení, čerpanie medzinárodná skupina geniálnych mozgov z každej disciplíne.
So vzostupom nacistickej moci, všetci Haber židovské zamestnanci boli nútení odstúpiť, a byť Žid sám rezignoval rovnako. On bol ponúkol útočisko na univerzite v Cambridge, ale zostal len štyri mesiace. Haber príspevky k vedeckému pokroku, aj napriek diskusia obklopovať jeho vojnové aktivity, bol široko uznávaný a rešpektovaný za svojho života.
Po Habera smrti, nemecký fyzik Max Theodor Felix von Laue viedol iniciatívu na premenovanie Kaiser Wilhelm Institute v pamäť Haber. To je teraz známe ako Fritza Habera ústavu.