Druhá svetová vojna (1939 - 1945), prerušil Menzela akademickú kariéru. Od roku 1942 do roku 1945, ako veliteľ, on slúžil v americkom námorníctve a učil kryptológie, ktorý zahŕňa vytváranie a prekladaní správ na tajný kód. On tiež robil výskum o vplyve slnečnej aktivity na rádiových vĺn komunikácie a rozhlasové propagácie. Vojna preukázala hodnotu rádiovej komunikácie a vplyv slnečnej aktivity na ňom. Potom, Menzel pomohol US Air Force zriadiť observatórium na Sacramento Peak blízko Alamogordo v Novom Mexiku.
Menzel naďalej najmä fascinovaný zatmenie slnka, a on viedol zatmenie výpravu na Sibír v roku 1936. On cestoval glóbus a bol svedkom viac než tucet zatmenie Slnka v jeho celom živote.
A plodný autor, zatiaľ čo pracuje na svojom doktorátu v Princetone pomohol živiť sa tým, že píše sci-fi príbehy. Neskôr v živote, on bol redakčný poradcu rôznych periodikách, vrátane Galaxy Magazine, sci-fi časopisu. Cez jeho záujem o science fiction, však, on napísal tri knihy odhaľovať UFO a vizitácie mimozemskými bytosťami. Tvrdil, že takéto javy boli výsledkom buď prejavov rôznych prírodných javov alebo optický klam.
Menzel pomohol popularizovať pole astronómie. Napísal niekoľko kníh smerujúce k širokej verejnosti vrátane Poľné sprievodca hviezd a planét (1964), populárny príručka pre začínajúcich astronómov a naše Slnko (1949), štandardné referencie na túto tému.
Spolu s jeho akademickej kariére, Menzel tiež slúžil ako konzultant pre rôzne vládne a vojenské organizácie. On bol blízko oboznameny s prezidentom Johnom F. Kennedym, čo zodpovedá často sa s ním počas predsedníctva Kennedyho o rôznych politických a vedeckých otázkach. 
[1] [2]