retrovírusov spoliehať na bielkoviny katalyzátor s názvom proteáza as súčasťou ich reprodukčný proces. Inhibovaní že bielkoviny hodí univerzálny kľúč do retrovírusu strojov ničenia. Skutočne, tieto inhibítory proteázy sa už používa na liečbu HIV infekcie u pacientov s AIDS [zdroj: Britannica].
Bohužiaľ, česanie sa štruktúry takých proteínov je jedným z najťažších hlavolamov poznáme. Predstavte si, že plnenie obrie krabice s zamotaný vianočné stromčeky, nepoužívaných Slinky hračky, ostnatý drôt, lepiace pásky a elektromagnety, potom triasla a otáčate okolo, a nakoniec sa snaží uhádnuť, čo tvar, ktorý urobil. Tie som len začal poškriabať povrch zložitosti tejto úlohy. Proteíny sa môže skladať z viac ako 10.000 atómov za kus, tvoriť reťazce, čiastkové reťaze a dlhopisy v nespočetných kombinácií; V skutočnosti existuje viac spôsobov, ako zložiť bielkovín, než tam sú atómy vo vesmíre [zdroj: Bohannon].
Táto zložitosť je viac než dokonca superpočítač môže niekedy zvládnuť, najmä preto, že počítače nie sú zvlášť dobré na pracuje s trojrozmernými tvarmi. Takže vedci začali hľadať rýchlejší a účinné prostriedky k praskaniu proteínovej štruktúry. Ich riešenie? Použite vrodené priestorové analýzy schopnosti ľudského mozgu. Foldit sa narodil. Takmer okamžite začal platiť dividendy.
V tejto ďalšej časti sa budeme sa bližšie pozrieť na to, ako Foldit funguje, čo hráči dosiahli s ním, a či alebo nie oni vyliečený HIV.
Molekulárna Clockwork
Nevyhnutnou súčasťou hodinárskeho remesla skladá z montáže zbierku jemných súčiastok v tak kompaktný priestore, ako je to možné, a zároveň zabezpečiť, aby obmedzenom priestore nie sú v rozpore s funkciou Hodinky sa.
V Foldit, hráči použiť jednoduché okno nástrojov manipulovať tvar proteínu. Myšlienka je ohýbať, krútiť, pohybovať a triasť proteínu v postranných reťazcoch a aminokyselín skelety, tak, že sa celá štruktúra je zabalená do optimálnej podoby. Hráči vedia, že ich riešenie funguje, keď sa zbaviť kolízií medzi postranných reťazcov atómov, skryť hydrofóbne reťazce vnútri proteínu, tvárou v tvár hydrofilné reťaze smerom von a odstrániť veľké prázdne priestory, ktoré ohrozujú stabilitu proteínu - to všet
