skóre, spoločne s pravidlami pre prípustné ťahy, pochádza z fyzikálnych zákonov, ktorými sa riadi drážkovanie bielkoviny. Termodynamika nám hovorí, že prírodné systémy inklinujú k štátoch nižšia energiou. Ostatné fyzikálne zákony, ako je napríklad vzájomnej príťažlivosti opačných nábojov, odpudzovanie, ako sú poplatky a obmedzenia, pokiaľ ide o tom, ako atómové väzby môžu byť usporiadané a otáčať, je tiež postavená v roku.
Program Foldit abstrahuje údaje do formy, ktorá oko vnímať a mozog môže pochopiť. Fyzika sa manipuluje v zákulisí, uvoľnenie hráči manipulovať s tvarmi cez dôkladné analýzy, inštinkt, alebo čo metóda vyhovuje im.
Počas roka od jeho úvode, Foldit hráči produkoval proteín-skladací riešenia, ktoré zatienil ktoré podala molekulárnej biológovia. Inšpirovaný skoré úspechy, tvorcovia Foldit uplatňovaných program na iné proteíny a úlohou hráča s navrhovaním novej bielkoviny pre boj s rakovinou, AIDS a Alzheimerovej choroby. Napríklad p53 tumor suppressor proteín je poškodená u mnohých pacientov s rakovinou. Ak je opraviť alebo vymeniť, môže taký proteín zastaviť rast nádoru.
Úspešne záhadný z enzýmu proteázy MPMV je vrcholom z Foldit kariéry tak ďaleko. Predtým, než sa tam dostali aj keď hráči žalúdok cez desiatky tisíc neustále zvyšovala prototypov až do menej ako tri týždne po tom, čo začali, oni vyriešil tento konkrétny proteín puzzle [zdroj: Niemeyer]. Nebol to liek na HIV, ale vďaka retrovirálním rodové podobnosti, MPMV bielkoviny katalyzátor pomôže vedeckým pracovníkom budovať lepší antiretrovirálne lieky, s ktorými sa v boji proti HIV.
Foldit nie je bez obmedzenia, ani je to Rosetta kameň pre všetky proteíny. Avšak, to umožnilo dav hráčov predvídať štruktúru proteínu, ktorý sa vzoprel všetky tradičné prístupy, a to samo o sebe ospravedlňuje jej hodnotu ako nástroja pre molekulárnu analýzu.
