Ale opäť, odborníci varujú, by možné škodlivé účinky na životné prostredie je potrebné skúmať. Metán je silný skleníkový plyn (plyn, ktorý prispieva k otepľovaniu atmosféry). Ak boli oslobodení veľké množstvá metánu počas procesu obnovy a dovolené uniknúť do atmosféry, tam mohol byť nepredvídateľný vplyv na svetovú klímu. Niektorí vedci tiež podozrenie, že občasné tavenie hydrátov metánu vreciek spôsobuje obrovské podvodná zosuvy, čo môže vyvolať ničivé vlny cunami (obrovské vlny spôsobené búrkami alebo poruchy Pod vodou). Ťažba metánu z mora by preto mohlo prispieť k ešte viac zosuvy pôdy a cunami. Iní vedci sa však povedať, že boli prehnané možné nepriaznivé dôsledky ťažby hydrátov metánu. For S podlahe mora ako toxické skládky
Ďalšie potenciálne použitie pre hlbokomorského poschodí je likvidácia také nebezpečné látky ako sú jadrových odpadov a toxických chemikálií. Niektorí odborníci sa navrhla za použitia miest v blízkosti stredu veľkých oceánskych stabilné dosky, hlboko pokryté sedimentu, na tento účel. Jeden navrhol spôsob likvidácie je vyvŕtať hlboký otvor v sedimente, čerpadlo odpadu dole vo forme suspenzie, a tlačiť sediment späť do diery. Častice ílu oceánskeho sedimentu predstavujú obrovskú prekážku pre pohyb odpadu.
