Okrem regulácie cestovného ruchu, mnoho organizácií, a to ako vnútroštátnej a medzinárodnej, pracujú spoločne pokúsiť sa vyriešiť problémy na Galapágoch. Na Charles Darwin Research Station (CDR) na ostrove Santa Cruz, vedci dosiahnuť nejaký úspech s programom mláďa povedomia pre obrie korytnačky v snahe o zvýšenie počtu tohto ohrozeného druhu. Oblasti CDR je výskum rameno Charles Darwin nadácie pre Galapagos ostrovoch (CDF), čo je organizácia, ktorá bola založená v roku 1959 medzinárodná skupina vedcov, ktorí sa stal obavy o zničenie Galapágy voľne žijúcich živočíchov. Nadácia pôsobí pod záštitou Organizácie spojených národov pre výchovu, vedu a kultúru (UNESCO), IUCN (Svetový zväz ochrany prírody) -a nadnárodnej zachovanie a poľovníctva organizáciu-a vládou Ekvádoru. Účelom CDF je radiť vláde na stratégií pre ostrovy zachovanie a prevádzkovať CDR. Vedci CDRS zhromažďovať údaje na morské prostredie ostrovov, študovať účinky nedávno zavedených rastlín a zvierat, a rozvíjať ekologické výukové programy.
V roku 1968, Ekvádor založená na Galapágoch National Park Service (HNP) na realizovať ciele v úsporách stanovenej CDRS a dohliadať na národný park Galapágy. V roku 1986, vláda založila Galapágy morských zdrojov Reserve. Rezerva sa skladá z viac ako 70.000 štvorcových kilometrov (27,000 míľ štvorcových) vodách v okolí ostrovov, definovanej 28 kilometrov (17 míľ) hranicu. V novembri 1996, Ekvádore Národný inštitút pre lesníctvo a národných parkov vyhlásil morskej rezervácie je súčasťou Národného parku Galapágy. Žiadne komerčný rybolov je povolený v oblasti, a tradičný rybolov je povolený iba v určitých častiach. Okrem toho, právne predpisy upravujúce veľkosť a druh rýb a morských tvorov, ktoré môžu byť prijaté, aby sa mladí a reprodukciu členovia druhu sú ponechané na zabezpečenie dlhodobej prežitie morského života ostrovov. Mnoho ochrancovia prírody v polovici 1990 tvrdil však, že federálna vláda nedokázala dostatočne strážiť morskou rezervácií a presadzovať predpisy. Ochr
