No, nie tak celkom. Aj keď ani jeden typ auta vyrába znečistenia na výfuku, obaja majú potenciál na výrobu znečistenia pri ich " paliva " je vytvorený. Palivo, že auto na elektrický pohon beží na je elektrina (ktorý sa používa na nabíjanie batérií) a palivo, ktoré bunka auto vodíkovými palivovými beží na vodík (ktorý sa používa na výrobu elektriny). Že elektrina a že vodík musia odniekiaľ prísť. Elektrina bude pochádzať z elektrární, ktoré vo väčšine prípadov sa spaľovaním fosílnych palív na výrobu elektrickej energie a že týchto fosílnych palív môže spôsobiť rovnaké znečistenie, ktoré auto na elektrický pohon je určená, aby sa zabránilo. Vodík pre vozidla poháňaného palivovými článkami bude s najväčšou pravdepodobnosťou byť produkovaný v budúcnosti elektrolýzou, čo zahŕňa elektrinu prechádzajúcej cez vodu. A že elektrina príde z rovnakých potenciálne znečisťujúcich zdrojov, ako je elektrickej energie používanej na nabíjanie akumulátorov elektromobilu je.
Pravdou je, že autá na elektrický pohon a vozidlá s vodíkovými palivovými článkami obaja majú potenciál byť nádherne non-znečisťujúce formy dopravy, ale aby sa im skutočne zelená budeme musieť prejsť od spôsobov výroby elektriny, ktoré spaľujú fosílne palivá. Namiesto toho, aby spaľovanie uhlia na výrobu elektriny, budeme musieť sústrediť na ekologicky čistých metódy, ako sú vodné, solárna energia, veterná energia a jadrovej energie, ktoré produkujú málo alebo žiadne emisie znečisťujúcich látok. Až príde deň, že väčšina našich elektriny pochádza z týchto zdrojov, auto na elektrický pohon a vodíkový palivový článok auto bude ako byť takmer dokonalé formy zelene, non-znečisťujúce dopravy.