V roku 1963 plukovník Enrique Peralta Azúrdia viedol úspešnú vzburu. On riadi vyhláškou, ale sľúbil usporiadať voľby po tom, čo nová ústava bola uzákonená. Ústava nadobudla platnosť v roku 1965 a civilná vláda bola zvolená. Je to pokus o hospodárske a sociálne reformy, ale jeho programy boli blokované odpor konzervatívnych podnikateľov a bohatých vlastníkov pôdy. Počas 1970 a čoskoro 1980, reforma bola ďalej odložené sérií konzervatívnych vojenských vlád, ktoré boli zvolení uprostred obvinenia súperov volebného podvodu.
V roku 1986 nová ústava nadobudla účinnosť a civilná vláda bola obnovená. Avšak, vládne korupcia a porušovanie ľudských práv naďalej problémy do 1990. V roku 1994 sa vláda a komunistická partizáni podpísali dohodu o posilnení ľudských práv. V roku 1996 sa vláda a partizáni podpísali mierovú dohodu, končiť 35-ročný občiansku vojnu. Hurikán Mitch spôsobil rozsiahle škody v krajine v roku 1998.