Prezrite si článok History Honduras dejín Honduras
Vo storočiach pred európskym objavom Hondurasu, región bol obsadený Mayov, ktorých civilizácia vznikla okolo štvrtého storočia nášho letopočtu Niekoľko indiánske kmene, s celkovou populáciou asi 500.000, obývali Honduras, kedy Krištof Kolumbus dosiahol Honduras v roku 1502 na svojej štvrtej ceste. Španielsko je dobytie Indov a kolonizácie krajiny čoskoro nasledoval. V roku 1539 bola krajina robil provincii captaincy generál Guatemaly, a takmer 300 rokov španielskej nadvlády začal.
Spoločne s ostatnými provinciami Strednej Ameriky, Honduras vyhlásilo jeho samostatnosť zo Španielska v roku 1821 a čoskoro potom, pripojil sa k nim pri formovaní United provincie Strednej Ameriky. Konfederácia sa rozpadla v priebehu 1838-39 a Honduras sa stal nezávislou krajinou. Myšlienka federácie zostal populárny u mnohých Stredná vodcovia amerických, ale pokusy Hondurasu, Salvádoru a Nikarague v 1840 a 1850 sa tvoriť novú konfederáciu zlyhal.
Ako samostatné republiky, Honduras videl civilné spor , vzbura, a diktátorský pravidlom. Od roku 1855 do roku 1932 sa krajina mala 67 rôznych hláv štátov. Tam boli ozbrojené konflikty so susednými krajinami, zvyčajne cez územné nároky, a vojenská intervencia Spojených štátov (v roku 1907, 1912 a 1924-25). Hraničné spory boli vysporiadané s Guatemale v roku 1933, Nikaragua v roku 1960, a El Salvador v roku 1970.
Armáda prišla k sile v nekrvavom prevrate v roku 1972. V roku 1980 nová ústavné zhromaždenie bol zvolený a nová ústava vypracovaná , V roku 1981 bola obnovená civilnej vláde, keď Roberto Suazo liberálnej strany pravého stredu bol zvolený prezidentom. Armáda sa však aj naďalej hrať dôležitú úlohu. Liberálna strana zostala pri moci v roku 1980. Po krátkom období v rámci Národnej strany v skoro 1990, Carlos Roberto Reina liberálnej strany bol zvolený prezidentom v roku 1993. On zaviazali znížiť úlohu armády v civilných veciach. V roku 199S krajina bola zdrvená hurikánu Mitch, ktorý zabil viac ako 5000 Hondurasu.