Diego de Almagro, blízky spolupracovník Pizarra je, bol vyrobený guvernéra región na juh (Čile a južnej Bolívie). Nájdenie žiadne bohatstvo tam a pocit podvádzal, Almagro chytil Cuzco z Pizarro síl. Pizarro retook mesto a dal Almagro k smrti v roku 1538. V roku 1541 Pizarro bol zabitý nasledovníkov Almagro. Ak chcete vytvoriť poradie Charles ja Španielska poslal miestokráľa, ktorý bol zosadený v roku 1548 tým, Gonzalo Pizarro, Francisco je nevlastný brat, ktorý mal skôr vyhlásil, že je guvernérom. Royal autorita bola založená v roku 1548.
Viceroyalty Peru
Vzhľadom k zlata a striebra, Peru bol najdôležitejšie amerických kolónií Španielska. Viceroyalty zahrnuté všetky španielske južnej Ameriky, rovnako ako Panama, cez ktoré peruánsky poklad bola vykonaná byť poslaný do Španielska. Indiáni boli použité ako baníci, a občas oni sa vzbúrili pod drsnou španielskou vládou. Po povstaní v 1571, miestokráľ Francisco de Toledo mal Tupac Amaru, posledný prežívajúce člen inkskej kráľovskej línie, dať na smrť.
Peru bohatstvo priťahovalo pirátmi mnohých národností. V roku 1624 holandská východnej Indie spoločnosť obľahli Callao po dobu piatich mesiacov, v neúspešnom pokuse vziať Lima. V polovici 17. storočia, však, bane Peru hrali von, a kolónie začala klesať ekonomicky a politicky.
Oblasť k severu bola robil oddelené Viceroyalty nazvaný New Granada, v 1717. V roku 1776 tvorbe viceroyalty La Plata oddelený od Peru juhovýchodná časť kontinentu, vrátane hornej Peru (Bolívia), kde boli umiestnené míny. Captaincy generálny Chile stal sa nezávislý v Peru v 1778.
Indiáni boli utláčaní a zle spracovaný Španielskom. Oni boli nútení pracovať za nízke mzdy v oblastiach, bane a textilných tovární, a bol ťažko zdanená vedľa. V 1780 José Condorcanqui, ktorý prijal meno Tupac Amaru II, viedol neúspešnú indickej povstania, ktorá trvala tri roky.
Hnutie za nezávislosť
Prvý pohyby nezávislosť v Južnej Amerike prišla krátko po tom, čo Španielsko bolo nechytilo Napoleon Bonaparte v roku 1808. peruánskej úradníkov zostal lojálni ku španielskemu trónu, a miestokráľ bol pripravený poslať vojakov spurný miest v susedných regiónoch, ako aj vo svojej vlastnej.
revolučné sily získali silu, však, a V roku 1818 Čile, s pomocou José de San Martín Argentíny, získal nezávislosť. V revolutionists zahájil inváziu Peru v roku 1820, a Lima spadol bez boja v 1821. San Martín predpokladať aut
