Ak chcete byť odchýlený elektrického alebo magnetického poľa, atómy musí najprv byť ionizované, alebo sa zmenil na nabité častice. Toho sa dosiahne tým, že dorazí vo vzdialenosti jedného alebo viacerých elektrónov, čo má za následok častice s čistým pozitívnym nábojom. Spectrometrists niekedy bombardujú vzorka s lúčom elektrónov pre ionizáciu molekuly. Prichádzajúce elektróny správať ako biliardové gule, klepanie preč elektróny vo vzorke. Oni tiež použiť techniku známu ako elektrosprejové ionizácie, ktorá núti vzorku cez nabitú ihly strhnúť elektróny. V každom prípade tento prvý krok hmotnostnej spektrometrie prináša pozitívne ióny.
Ďalej sú kladné ióny sa musí pohybovať von z ionizačnej komory. Sila potrebná na je presunúť ich z elektrického poľa dodanej dva kovové mriežky jeden rošt je kladne nabitá a odpudzuje ióny .; druhý je negatívne nabitá a priťahuje. Vzhľadom k tomu, odrazenie a atrakcie akt v rovnakom smere, sa ióny pohybujú rýchlo smerom k záporne nabitú mriežkou, ktorá je perforovaná s mnohými malými otvormi. Ióny prechádzajú otvormi v rôznych rýchlostiach. Ľahšie ióny cestovať rýchlejšie ako tie ťažšie.
Podľa zákonov elektromagnetizmu, pohybujúce sa prúd elektricky nabitých častíc bude generovať magnetické pole. Ióny v hmotnostným spektrometrom nie sú výnimkou. Oni produkujú magnetické pole ich vlastné, a to je to magnetické pole, ktoré vedci využívajú v najdôležitejším krokom spektrometria. Dostaneme sa k tomu v ďalšej časti
deformácií a detekcie iónov
Vytvorenie a urýchľovanie iónov sú v podstate prípravné kroky ku skutočnej práci hmotnostnej spektrometrie -. Hmotnostný analýza , Hlavnou úlohou analyzátora masového ich aplikovať vonkajšieho magnetického poľa, aby ióny vystupujúcich ionizačné komory. Tento externý pole interaguje s magnetickým poľom generované rýchlo sa pohybujúcich častíc, čo cestu každej častice až mierne ohýbať. Koľko cesta krivky iónovým závisí od dvoch faktorov: hmotnosť iónu a jeho náboja. Ľahšie ióny a ióny s väčším nábojom byť odchýlený viac ako ťažšie ióny a ióny s menším poplatok.