Tento proces, ktorý umožnil, aby sa minútu vzorku genetického materiálu a duplikovať dosť to pre štúdium, čoskoro našiel mnoho použitie. Vzhľadom na to, že umožnila rýchlu identifikáciu a zosilnenie častí ľudského genómu, to hralo významnú úlohu v úsilí o zmapovanie ľudského genómu. Vzhľadom k tomu, že môže priniesť množstvo, ktoré môžu byť analyzované, to robilo to ľahšie odhaliť infekčné choroby organizmov, ktoré boli ťažké kultúre. Vzhľadom na to, že môže ľahko rozlíšiť medzi drobnými odchýlkami v DNA, to viedlo k novým druhom genetického testovania. To sa aj stalo dôležitým nástrojom policajného vyšetrovania, pretože to môže identifikovať osobu, ktorá vľavo kvapku krvi alebo jedného vlasy na mieste činu. Jeho užitočnosť pri analýze praveké DNA navrhol pozemok pre Michaela Crichtona knihy a neskôr Steven Spielberg film Jurský park, v ktorom vedci duplikovať dinosaurie DNA extrahované z komára uchovaný v jantáru. To môže tiež pomôcť učenci dať dohromady tisíce častíc pergamenu z Mŕtveho mora roluje.
V roku 1986, odišiel Mullis Cetus. Spoločnosť mu nevenoval iba $ 10,000 bonus pre jeho vynález. Neskôr, DuPont je nadnárodná farmaceutická spoločnosť, žaloval Cetus cez patentového sporu tvrdí, že DuPont chemik mal vlastne vynašiel PCR v roku 1970. Cetus musel ustúpiť požiadavka Mullis k vynálezu alebo riskujete patent, ktorý sa ukázal vysoko ziskové. Keď farmaceutický gigant, Hoffmann-La Roche kúpila patent od Cetus v roku 1991, to zaplatil Cetus svetovo rekordné $ 300 mil.
Potom, čo pracoval od roku 1986 do roku 1988 v Xytronyx, Inc., Mullis stal voľnej nohe poradcu , Menej ako rok po tom, čo sa stal laureátom Nobelovej ceny, Mullis bol zakázaný od rozprávanie na zasadnutiach Európskej spoločnosti pre klinické skúšky, jedna z popredných európskych lekársky výskumnými organizáciami, a obvinil prezidentom spoločnosti zo podkopáva hodnotu výhry. Netrvalo dlho, to bolo široko pripustil, že Mullis je aspoň jeden z najviac nekonvenčné osôb, keď bola udelená Nobelova cena za chémiu. Jeho 1998 Dancing nahý vo Mind Field, kniha esejí, odhalil ho, aby bol zástancom astrológie a veriaci v cudzej únos.
Hoci kritizovaný vypov