Obmedzený užívanie antibiotík v ekologickom poľnohospodárstve viedlo k obavám o vysokej hladiny mikroorganizmov v hnoji, čo by postupne viedlo otravu z jedla, ako je E. coli. Tam je nedostatok dostatočné dôkazy na preukázanie organické trpia vyššia ako bežnej úrovni mikróbov, ale práve teraz štúdie uprednostňujú produkty ekologického poľnohospodárstva. Soil Association navrhuje manipulácia z hnoja na ekologických farmách sú v skutočnosti väčšia pravdepodobnosť, že zníženie množstva organizmov, a to menej ako 5 percent ohnísk otravy jedlom sú kvôli ovocia a zeleniny kontaminácii. Výskum pokračuje byť vykonávané na využitie organického odpadu vo všetkých typoch chovu.
Navyše, správa v roku 2002 naznačuje, ekologicky a vo voľnom výbehu kurčiat môže byť väčšia pravdepodobnosť, že Campylobacter infekcií, známu príčinu potravín otrava. Následné štúdie sú v plnom prúde.
Dokonca aj ekologického poľnohospodárstva pracovať na ochrane životného prostredia tým, že stavia zdravé pôdy a zdôrazňovať prírodných systémov, bez riadnej riadenie a znalostí, ekologických postupov môže spôsobiť problémy patogénov.
prínosy pre životné prostredie ekologického poľnohospodárstva sú hotly debatoval tému, a výskumníci aj naďalej študovať, ako udržateľné metódy môžu pomôcť liečiť - alebo aspoň nápovedy negovať - niektoré z účinkov akýchkoľvek ekologických záťaží produkovaných moderné-dňový poľnohospodársky systém, dúfajme, že zníženie hladiny chemických látok do pôdy a ovzdušia a nášho tela. Konvenčné múdrosť vyplýva, že čím viac rozumieme o našich potravinových zdrojov a ako ovplyvňujú naše telá a životné prostredie, tým lepšie.
Pre viac organických súvisiacich článkov a odkazov, nájdete na nasledujúcej stránke.