Niekedy pracovníci majú presmerovať existujúcich potrubí a káblov, než stavba môže pokračovať. V iných prípadoch, môžu pracovníci vykopať okolo nich a pozastaviť ich z povrchu vyššie uvedených. Občas, pracovníci odhaliť potrubia alebo potrubia, ktoré nie sú uvedené na žiadnom mesta plán - to pridáva ďalší krok presného určenia, na aký účel je potrubie slúži a či môžu byť odstránené. Ale v niektorých prípadoch, práce okolo rúr a rúrok, je ľahké. V mestách po celom svete, posádky našli rad ďalších prírodných a človekom spôsobených prekážkami pri hĺbení tunelov metra. Spoločný obtiaž zahŕňa podzemné vody. Pracovníci môžu objaviť niečo z voľnej, vlhkej pôdy kolektor podzemnej vody, alebo zdrojov podzemných vôd, pri kopaní. Niekedy môžu posádky používať čerpadla alebo vykopať odvodňovacie jamiek na účely odstránenia vody. Niektoré vodné zdroje vyžadujú extrémne opatrenia. Pri razení tunelov metra v Paríži, pracovníci používajú rúrky chloridu vápenatého nízkou teplotou do zmraziť nezvládnuteľný blato, čo im ho odstrániť, ako by to bol tuhý íl.
Okrem podzemnej vody, mnoho podchody má ku krížu rieky a ďalšie nadzemné vodných plôch. Niekedy, posádka môže kopať pod riekou pomocou moderných strojov tunelovanie. Avšak v niektorých prípadoch, pôda pod rieky je príliš mokré a blatistá riadiť. Kopanie pod riekou môže byť obzvlášť nebezpečné - pri razení metra liniek Paríž, pokúša sa zaryje pod Seine viedlo k niekoľkým utopeniu. V ďalšom pokuse, pracovníci klesla uzatvárateľné uzávery na dne rieky, potom používa stlačený vzduch na vynútenie všetku vodu z vnútra skrine. V medziach výbehu, posádky mohli udržať kopať. Práca bola ťažká, aj keď, a títo pracovníci zvyčajne dostal vyššie mzdy než tí, ktorí tunelovacie cez bežnú zemín a hornín.
V roku 1960, pracovníci v San Franciscu použiť verziu metódy cut-a-kryt sa vytvoriť tunel cez San Francisco Bay. Pracovníci vykopal priekopa, v ktorom sa pochovať prefabrikovaných tunelových úsekoch. Potápači umiestnená sekcia v presných polohách a zaistené ich k sebe. Pružné spoje na každom konci pomáhajú chrániť tunel z zemetrasení.
V niektorých prípadoch, v prírode sa vyskytujúci geologických útvarov môže
